全自动洗瓶机和手工清洗的对比主要体现在以下几个方面：

1. 清洗效率：全自动洗瓶机采用喷淋清洗的方式，可以快速、有效地清洗各种类型的玻璃器皿，批量化清洗的方式，标准清洗模式40分钟即可完成一批次器皿的清洗，清洗效率远高于手工清洗。手工清洗则需要耗费大量时间和精力，对于需要清洗大量的实验室器皿的实验室，机器清洗远大于手工清洗。

2. 清洗效果：全自动洗瓶机采用注射式喷淋以及专用清洗剂的共同作用，能够去除实验后瓶皿的残留物，清洗效果更标准。而手工清洗可能存在洗刷盲点，不同实验人员清洗出来的相同容器洁净度也可能不一样。

3. 对器皿的保护：全自动洗瓶机采用智能的控制系统，采用软启动水喷淋清洗方式，降低器皿的损坏率。而手工清洗时，大多会用上刷子等工具进行清洗，可能会导致器皿的破损。

4. 操作简便性：全自动洗瓶机具有人性化的操作系统，用户只需简单设置参数即可开始清洗，清洗过程中无需手工干预。

5. 安全性：全自动洗瓶机清洗过程中无需人员手工干预，在运行状态下会锁定清洗仓门，确保了清洗过程中人与瓶皿零接触；而手工清洗时，操作人员需要直接接触清洗液和器皿，存在一定的安全风险。

6. 环保性：全自动洗瓶机拥有自动识别功能，能够自动识别清洗中的放置篮架数量，自动调整水和洗涤剂的用量，且清洗过程中循环清洗用水，与手工清洗相比减少70%水量消耗。

全自动洗瓶机相比手工清洗具有更高的清洗效率、更好的清洗效果、更低的器皿损坏率、更简便的操作、更高的安全性和更好的环保性。因此，在实验室、制药厂等领域，全自动洗瓶机已经成为越来越多用户的选择。